Python利用多进程将大量数据放入有限内存的教程

　　简介

　　这是一篇有关如何将大量的数据放入有限的内存中的简略教程。

　　与客户工作时，有时会发现他们的数据库实际上只是一个csv或Excel文件仓库，你只能将就着用，经常需要在不更新他们的数据仓库的情况下完成工作。大部分情况下，如果将这些文件存储在一个简单的数据库框架中或许更好，但时间可能不允许。这种方法对时间、机器硬件和所处环境都有要求。

　　下面介绍一个很好的例子：假设有一堆表格（没有使用Neo4j、MongoDB或其他类型的数据库，仅仅使用csvs、tsvs等格式存储的表格），如果将所有表格组合在一起，得到的数据帧太大，无法放入内存。所以第一个想法是：将其拆分成不同的部分，逐个存储。这个方案看起来不错，但处理起来很慢。除非我们使用多核处理器。
目标

　　这里的目标是从所有职位中（大约1万个），找出相关的的职位。将这些职位与政府给的职位代码组合起来。接着将组合的结果与对应的州（行政单位）信息组合起来。然后用通过word2vec生成的属性信息在我们的客户的管道中增强已有的属性。

　　这个任务要求在短时间内完成，谁也不愿意等待。想象一下，这就像在不使用标准的关系型数据库的情况下进行多个表的连接。
数据

　　示例脚本

　　下面的是一个示例脚本，展示了如何使用multiprocessing来在有限的内存空间中加速操作过程。脚本的第一部分是和特定任务相关的，可以自由跳过。请着重关注第二部分，这里侧重的是multiprocessing引擎。

　　这里发生了神奇的事情：

　　 #runs the function and puts the answers in the queue def worker(row, q): ans = job_title_location_matcher(row[0],row[1]) q.put(ans) # this writes to the file while there are still things that could be in the queue # this allows for multiple processes to write to the same file without blocking eachother def listener(q): f = open(filename,wb) while 1: m = q.get() if m ==kill: break f.write(,.join(m) + n) f.flush() f.close() def main(): #load all your data, then throw out all unnecessary tables/columns filename = skill_TEST_POOL.txt #sets up the necessary multiprocessing tasks manager = Manager() q = manager.Queue() pool = Pool(cpu_count() + 2) watcher = pool.map_async(listener,(q,)) jobs = [] #titles_states is a dataframe of millions of job titles and states they were found in for i in titles_states.iloc: job = pool.map_async(worker, (i, q)) jobs.append(job) for job in jobs: job.get() q.put(kill) pool.close() pool.join() if __name__ == __main__: main()

　　由于每个数据帧的大小都不同（总共约有100Gb），所以将所有数据都放入内存是不可能的。通过将最终的数据帧逐行写入内存，但从来不在内存中存储完整的数据帧。我们可以完成所有的计算和组合任务。这里的“标准方法”是，我们可以仅仅在“job_title_location_matcher”的末尾编写一个“write_line”方法，但这样每次只会处理一个实例。根据我们需要处理的职位/州的数量，这大概需要2天的时间。而通过multiprocessing，只需2个小时。

　　虽然读者可能接触不到本教程处理的任务环境，但通过multiprocessing，可以突破许多计算机硬件的限制。本例的工作环境是c3.8xl ubuntu ec2，硬件为32核60Gb内存（虽然这个内存很大，但还是无法一次性放入所有数据）。这里的关键之处是我们在60Gb的内存的机器上有效的处理了约100Gb的数据，同时速度提升了约25倍。通过multiprocessing在多核机器上自动处理大规模的进程，可以有效提高机器的利用率。也许有些读者已经知道了这个方法，但对于其他人，可以通过multiprocessing能带来非常大的收益。顺便说一句，这部分是skill assets in the job-market这篇博文的延续。